El grupo de investigación de Ecología microbiana molecular de la Universidad de Alicante se dedica a la caracterización de dos tipos de comunidades microbianas: las que viven en ambientes extremos hipersalinos, y las asociadas en simbiosis con invertebrados marinos.

Principales líneas de investigación:

• Estudio del genoma de Salinibacter ruber. Con la financiación del Genoscope francés, se ha secuenciado el genoma de una cepa de Salinibacter ruber aislada de unas salinas de Mallorca.
  
  
• Estudio de la diversidad de ambientes hipersalinos y control de las poblaciones procariotas. Se están buscando sustancias con actividad antimicrobiana en microorganismos halófilos extremos. También se está estudiando la implicación de estos compuestos como factores en el control de las poblaciones procariotas.
  
  
• Estudio de metagenómica de las salinas: procariotas y fagos.
  
  
• Diversidad intraespecífica de Salinibacter ruber.
  
  
• Caracterización de la microbiota asociada a invertebrados marinos. La mayoría de productos naturales con potencial terapéutico se extraen de invertebrados marinos, y muchos de éstos se asocian en simbiosis con distintos microorganismos de los dominios Bacteria y Archaea. El grupo se ha centrado en la caracterización de la comunidad bacteriana simbionte asociada a la ascidia Cystodytes dellechiajei, que presenta actividad antiproliferativa frente a distintas líneas celulares tumorales.

Diversas aplicaciones

• Sector medioambiental. Caracterización de comunidades microbianas:
  
  - Cuantificación mediante técnicas convencionales de cultivo;
  - Cuantificación microbiana mediante técnicas moleculares más fiables que los cultivos convencionales: PCR, secuenciación, hibridación in situ, DGGE, metagenómica, etc.
  
  
• Técnicas de identificación y tipado de microorganismos mediante caracterización génica:
  
  - rRNA-16S;
  - Electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE) con aplicaciones en: clínica (infecciones hospitalarias), industria alimentaria (intoxicaciones alimentarias, control en el almacenamiento de alimentos, etc.), identificación de cepas resistentes a antibióticos, o construcción de metagenotecas.
  
  
• Identificación de problemas de contaminación: alimentos, industria, aguas, etc.
  
  
• Estudio de microorganismos de ambientes extremos (marinos, hipersalinos…). Las técnicas para su caracterización se pueden aplicar en otros sectores.
  
  
• Virus medioambientales no patógenos: bacteriófagos.